Libro I: Causas de las Guerras Médicas)
Libro II: Descripción de la geografía y etnografía de Egipto, e historia del país.
Libro III: Causas que indujeron a Cambises a atacar Egipto. Campaña militar. Muerte de Cambises y entronización de Darío I.
Libro IV: Expansión persa: Escitia. Campañas contra los escitas. Campaña contra Libia.
Libro V: Avance persa contra Grecia. Operaciones contra Macedonia y Tracia. Sublevación jonia. Aristágoras de Mileto pide ayuda a Esparta y Atenas, lo que sirve para desarrollar la Historia de estas dos ciudades.
Libro VI: I Guerra Médica. Incursión persa en Macedonia. Historia contemporánea de Esparta y Atenas. Desembarco persa en el Ática. Batalla de Maratón. Alcmeónidas y Milcíades.
Libro VII: Muerte de Darío, Jerjes I toma el mando del Imperio aqueménida y decide la invasión de Grecia. Paso del Helesponto, batalla de las Termópilas.
Libro VIII: Batalla de Artemisio. Ocupación y destrucción de Atenas. Batalla de Salamina. Retirada de Jerjes.
Libro IX: Batallas de Platea y Micala. Trágicos amores de Jerjes. Toma de Sestos por los atenienses. Opinión de Ciro sobre riesgos del expansionismo.